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Come rimuovere documenti da più raccolte in base all'ID in MongoDB?

Attualmente, questo semplicemente non è possibile. Per accedere a due raccolte dovresti utilizzare il framework di aggregazione che, tuttavia, non può eseguire alcuna manipolazione dei dati in questa fase. Inoltre, il requisito "alla volta" richiederebbe il supporto per le transazioni che al momento è disponibile solo in una versione beta, quindi di nuovo, sfortuna.

La conclusione è:l'approccio suggerito con la richiamata è la strada da percorrere.