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Aggiornamento/sostituzione in blocco di Mongodb C# nella sottoraccolta

Leggi l'operatore posizionale . In questo caso, non hai bisogno di massa, solo UpdateMany.

collection.UpdateMany(
  Builders<RootDocument>.Filter.Eq("Documents.Id", document.Id),
  Builders<RootDocument>.Update.Set("Documents.$", document));

Questo passerà attraverso la raccolta e corrisponderà a qualsiasi RootDocument che ha un ChildDocument con l'ID specificato e successivamente lo sostituirà con il documento fornito.