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Spring Data MongoDB:ignora gli oggetti vuoti

Una cosa che puoi fare qui è scrivere il tuo convertitore personalizzato per MainDoc :

public class MainDocConverter implements Converter<MainDoc, DBObject> {
    @Override
    public DBObject convert(final MainDoc source) {
        final BasicDbObject dbObject = new BasicDBObject();
        ...
        if(/* validate is subdoc is not null and not empty */) {
            dbOject.put("subDoc", source.getSubDoc());
        }
    }
}

Puoi registrarlo in @Configuration file ad esempio:

@Configuration
@EnableMongoRepositories(basePackages = {"package"})
public class MongoConfig {

    private final MongoDbFactory mongoDbFactory;

    public MongoConfig(final MongoDbFactory mongoDbFactory) {
        this.mongoDbFactory = mongoDbFactory;
    }

    @Bean
    public MongoTemplate mongoTemplate() throws Exception {

        final MongoTemplate mongoTemplate = new MongoTemplate(mongoDbFactory, getDefaultMongoConverter());
        return mongoTemplate;

    }

    @Bean
    public MappingMongoConverter getDefaultMongoConverter() throws Exception {

        final MappingMongoConverter converter = new MappingMongoConverter(
                new DefaultDbRefResolver(mongoDbFactory), new MongoMappingContext());
        converter.setCustomConversions(new CustomConversions(Arrays.asList(new MainDocConverter())));

        return converter;
    }

}

Se non vuoi scrivere un convertitore personalizzato per il tuo oggetto giocattolo puoi usarne uno predefinito e modificarlo un po'.

final Document document = (Document) getDefaultMongoConverter().convertToMongoType(mainDoc);

if(/* validate is null or is empty */) {
    document .remove("subDoc");
}

mongoTemplate().save(document);

In realtà non è il modo migliore. Poiché i ragazzi hanno scritto, l'oggetto vuoto dovrebbe essere archiviato come {} , ma il convertitore può aiutarti con il tuo caso.