È stato pubblicato un bug per questo problema:https://jira.mongodb.org/browse/ SERVER-13735
Problema simile, viene inviato un GeoJSON valido per un indice 2dsphere e causa il messaggio "Impossibile estrarre le chiavi geografiche dall'oggetto, geometria non corretta?" errore.
Si sono verificati una serie di bug precedenti in cui GeoJSON valido stava causando questo messaggio di errore. Li hanno corretti in 2.6.x ma questo sembra essere nuovo. Interverrei su JIRA in quanto aiuterà a dargli la priorità per una correzione.