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Come posso verificare la presenza di documenti duplicati in Mongoose?

Se vuoi ottenere un elenco di identici (tranne per _id campo, ovviamente) documenti nella tua collezione, ecco come puoi farlo:

collection.aggregate({
    $project: {
        "_id": 1, // keep the _id field where it is anyway
        "doc": "$$ROOT" // store the entire document in the "doc" field
    }
}, {
    $project: {
        "doc._id": 0 // remove the _id from the stored document because we do not want to compare it
    }
}, {
    $group: {
        "_id": "$doc", // group by the entire document's contents as in "compare the whole document"
        "ids": { $push: "$_id" }, // create an array of all IDs that form this group
        "count": { $sum: 1 } // count the number of documents in this group
    }
}, {
    $match: {
        "count": { $gt: 1 } // only show what's duplicated
    }
})

Come sempre con il framework di aggregazione, puoi provare a dare un senso a cosa sta succedendo esattamente in ogni passaggio commentando tutti i passaggi e quindi riattivando tutto di nuovo passo dopo passo.