In realtà non hai bisogno del modulo MangoDB per Kohana a cui ti sei collegato. Puoi semplicemente usare il driver nativo MongoDB di PHP. Il linguaggio di query mongo è piuttosto semplice, se conosci un po' di MySQL, questa pagina potrebbe aiutare...
http://www.php.net/manual/en/mongo.sqltomongo .php
Ecco un esempio che utilizza il driver, si collega, si avvia e si inserisce in una nuova raccolta e quindi seleziona tutti i dati nella raccolta...
$m = new Mongo();
$db = $m->my_database;
$db->my_new_collection->insert(array("a" => 1, "b" => 1));
$found_data = $db->my_new_collection->find();
Maggiori informazioni su http://www.php.net/manual/en/ mongo.manual.php
Se vuoi usare MangoDB, ti suggerisco di leggere il codice e controllare i forum di kohana per informazioni su di esso.
http://forum.kohanaframework.org/search?Search=mangodb