Verifica che la tua copia di mongodump e il database stesso siano della stessa versione.
Ho avuto lo stesso identico problema (completo senza output o registri del terminale) quando ho provato a eseguire un dump di un server mongo 3.2.4 con un client mongodump 2.4.1. La rimozione del client precedente e l'installazione di quello più recente lo hanno risolto immediatamente.
