Attualmente (MongoDB 3.2) l'aggregazione non supporta l'esecuzioneStats, con l'opzione di spiegazione nell'aggregazione si ottengono alcuni dati relativi alla query ma non sono presenti esecuzioneStats. Viene proposto e puoi verificarne lo stato qui
https://jira.mongodb.org/browse/SERVER-19758
Si prega di aggiornare il problema se si desidera implementarlo presto.