Ho fatto una rapida ricerca nella fonte e non vedo un modo ovvio per passare argomenti aggiuntivi a mongod avviato da meteor in modalità sviluppo. La mia raccomandazione sarebbe quella di avviare un mongod separato sul tuo sistema con quegli argomenti e poi dì a meteor di usare quello invece. Ad esempio:
$ MONGO_URL="mongodb://localhost:27017/myapp" meteor