MongoDB ha memorizzato procedure Javascript, ma non uno scheduler.
http://docs.mongodb.org/manual/ tutorial/store-javascript-function-on-server/
Puoi attivarlo da una macchina client usando un lavoro cron e la shell mongo. Tuttavia, consiglio vivamente di eseguire semplicemente uno script in Python o un linguaggio di scripting lato client simile. Sarà molto più facile controllare la versione ed eseguire il debug rispetto a Javascript lato server.