Nel tuo esempio, stai effettivamente utilizzando DocumentDB con compatibilità MongoDB. Non stai usando MongoDB nativo (né questo MongoDB nativo come servizio).
DocumentDB (anche con compatibilità MongoDB) non fornisce un oplog. E poiché Meteor ha una dipendenza dalla lettura dell'oplog, non saresti in grado di puntare Meteor su DocumentDB.
Nel tuo caso, dovresti eseguire MongoDB nativo da solo (ad es. in VM) o sfruttare una soluzione di hosting MongoDB di terze parti che fornisce supporto MongoDB all'interno della stessa regione della tua app. (ok, sì, puoi eseguire la tua app in una regione diversa, ma vedresti latenza insieme ai costi di uscita dei dati).