Penso che ci sia qualche configurazione predefinita che manca in questa versione del client mongoDb. Prova a eseguire:
mongo 127.0.0.1:27017
È strano, ma poi ho riscontrato che il problema è scomparso :) (quindi il semplice comando 'mongo' senza parametri ha ricominciato a funzionare per me)
[Ubuntu Linux 11.10 x64 / MongoDB 2.0.1]
