Esporta il risultato del framework di aggregazione mongodb in una nuova raccolta

A partire da Mongo 2.6.0 puoi farlo in modo nativo senza alcuna manipolazione aggiuntiva.

db.<collection>.aggregate( [
     { <operation> },
     { <operation> },
     ...,
     { $out : "<output-collection>" }
] )

Controlla il nuovo operatore di aggregazione $out per un esempio più dettagliato.

PS in questo modo non sei limitato alla dimensione di 16Mb.