puoi usare sqlcmd
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms162773 .aspx
quindi averlo in un file batch e pianificato tramite l'utilità di pianificazione di Windows
esempio sotto
sqlcmd -E -S localhost -q "select count(1) from databasename.dbo.tablename"
questo si connetterà a sql sul computer locale ed eseguirà un conteggio delle righe sulla tabella nel database