...
NOT IN (SELECT email COLLATE SQL_Latin1_General_CP1_CI_AS AS email FROM Customer)
Il bit di confronto segue sostanzialmente il nome della colonna.
Oppure questo (dipende da quello che vuoi):
SELECT * FROM #temp WHERE email collate SQL_Latin1_General_CP1_CI_AS NOT IN (SELECT email FROM Customer)
Infine, se il tuo DB è SQL_Latin1_General_CP1_CI_AS, un'opzione è usare ...COLLATE Database_Default... per forzare a un'impostazione predefinita.
