Non credo sia possibile. Per prima cosa, gli ottimizzatori di query presuppongono un elenco specifico di elementi simili a tabelle nella clausola FROM.
La soluzione più semplice che mi viene in mente sarebbe un'UNIONE tra le due tabelle:
SELECT md5
FROM hr
WHERE @clienttype = 'Employee'
AND current = 2
UNION
SELECT md5
FROM other
WHERE @clienttype = 'Member'
AND current = 2;
Solo la metà di UNION potrebbe essere True, dato il predicato @clienttype.