È possibile includere tutti i file di configurazione nell'installazione e quindi puntare a quello corretto tramite una variabile di ambiente. So che vuoi cambiare il file di configurazione in base alla configurazione della build della soluzione, ma cercherai una soluzione complessa quando esiste un'alternativa più semplice.
È abbastanza semplice aggiungere informazioni di registro durante l'installazione del pacchetto che imposterà la variabile di ambiente della macchina sotto la chiave:
HKLM\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\Environment\MyVariable
...al percorso di .dtsConfig per l'ambiente corrente.
