L'articolo "Apportare modifiche allo schema nei database delle pubblicazioni" dovrebbe coprire la maggior parte di ciò che devi sapere. A differenza delle versioni precedenti di SQL Server, dovresti essere in grado di apportare le modifiche DDL (supponendo che tu non abbia disattivato le impostazioni predefinite di replica).
Come menzionato nell'articolo, non potrai utilizzare SSMS per apportare queste modifiche.