Ho avuto lo stesso problema che hai avuto tu circa un anno fa. Dai un'occhiata alle risposte qui, ci sono alcuni ottimi suggerimenti dalle persone lì dentro:CodeIgniter Connessione MSSQL
Inoltre, qualche giorno fa è stato pubblicato un thread qui:Collegamento CI a SQL SERVER - controlla anche la mia risposta laggiù, poiché ha risolto il problema per quel particolare sviluppatore.
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