Ho avuto problemi con le tabelle del provider di appartenenze ASP.NET (indici non cluster) e mancava il "WITH (NOLOCK)" istruzione sulla procedura memorizzata aspnet_Membership_GetNumberOfUsersOnline ecc.
Lo strumento di migrazione trovato qui ha risolto i problemi ed esportato il database in Azure.
https://sqlazuremw.codeplex.com/
È una bella procedura guidata che si connette al tuo SQL Server esistente e migra il database selezionato ad Azure.