Aggiungi il cast mancante, usando:
class CastingArray(ARRAY):
def bind_expression(self, bindvalue):
return cast(bindvalue, self)
E quando definisci il modulo usa questa classe invece di ARRAY
(old_passwords = db.Column(CastingArray(JSONB))
(Risposta tratta da https://groups.google.com/forum/# !topic/sqlalchemy/oB4zVgUEMgA )