Basta aggiungere server_default o default argomento nei campi della colonna:
created_on = db.Column(db.DateTime, server_default=db.func.now())
updated_on = db.Column(db.DateTime, server_default=db.func.now(), server_onupdate=db.func.now())
Preferisco il {created,updated}_on nomi di colonna.;)
Documenti SQLAlchemy su inserimento colonna/aggiornamento predefinito .
[Modifica]: Codice aggiornato per utilizzare server_default argomenti nel codice.
[Modifica 2]: Sostituito onupdate con server_onupdate argomenti.