È più efficiente creare la connessione al database una volta per lavoratore, anziché una volta per attività. Sfortunatamente, mclapply non fornisce un meccanismo per inizializzare i lavoratori prima di eseguire le attività, quindi non è facile farlo usando il backend doMC, ma se usi il backend doParallel, puoi inizializzare i lavoratori usando clusterEvalQ. Ecco un esempio di come ristrutturare il codice:
library(doParallel)
cl <- makePSOCKcluster(detectCores())
registerDoParallel(cl)
clusterEvalQ(cl, {
library(DBI)
library(RPostgreSQL)
drv <- dbDriver("PostgreSQL")
con <- dbConnect(drv, dbname="nsdq")
NULL
})
id.qed.foreach <- foreach(i=1588:3638, .inorder=FALSE,
.noexport="con",
.packages=c("DBI", "RPostgreSQL")) %dopar% {
lst <- eval(expr.01) #contains the SQL query which depends on 'i'
qry <- dbSendQuery(con, lst)
tmp <- fetch(qry, n=-1)
dt <- dates.qed2[i]
list(date=dt, idreuters=tmp$idreuters)
}
clusterEvalQ(cl, {
dbDisconnect(con)
})
Poiché doParallel e clusterEvalQ utilizzano lo stesso oggetto cluster cl
, il ciclo foreach avrà accesso all'oggetto di connessione al database con
durante l'esecuzione delle attività.