flask.ext. è un modello deprecato che è stato utilizzato prevalentemente nelle estensioni e nei tutorial precedenti. L'avviso ti dice di sostituirlo con l'importazione diretta, che suppone essere flask_mysql . Tuttavia, Flask-MySQL utilizza un modello ancora più obsoleto, flaskext. . Non c'è niente che tu possa fare al riguardo oltre a convincere il manutentore a rilasciare una nuova versione che lo risolva. from flaskext.mysql import MySQL dovrebbe funzionare ed evitare l'avviso, sebbene preferibilmente il pacchetto venga aggiornato per utilizzare flask_mysql invece.
