La tua domanda copre un argomento molto complesso con molte questioni che devono essere considerate prima di decidere una soluzione. Fattori come la quantità di dati modificati per intervallo di tempo, la larghezza di banda e la latenza della connessione di rete, l'affidabilità della connessione di rete, la sicurezza dei dati, l'autenticazione, l'autorizzazione, le procedure di backup e ripristino, il failover e la tolleranza agli errori sono solo l'inizio.
Questo articolo di Amazon illustra la replica di un database MySQL ospitato in locale su RDS. Un bocconcino interessante di questo articolo è:
Migrazione dei dati MySQL in locale ad Amazon RDS
