Non puoi eseguire il comando MySQL o PHP all'interno di javascript, quello che puoi fare invece è creare una funzione PHP che puoi chiamare da Ajax. Il modo migliore è utilizzare jQuery o tramite reindirizzamento la pagina con la tua funzione PHP nell'URL.
<script type="text/javascript">
if (confirm("This seems to be Duplicate. Do you want to continue ?"))
{
$.ajax({
url: 'your_path_to_php_function.php',
type: 'POST', // Or any HTTP method you like
data: {data: 'any_external_data'}
})
.done(function( data ) {
// do_something()
});
}
else
{
window.location = 'your_url?yourspecialtag=true'
}
</script>
