Se la tabella email_data_test è MyISAM ed era bloccata, ciò avrebbe trattenuto l'INSERT.
Se la tabella email_data_test è InnoDB, allora molti dati MVCC sono stati scritti in ib_logfiles, cosa che potrebbe non essere ancora avvenuta.
In entrambi i casi, hai fatto scorrere la clausola LIMIT attraverso 4.480.000 righe solo per arrivare a 10.000 righe effettivamente necessarie per INSERT.
L'uccisione della query provoca solo l'esecuzione di un rollback nella tabella InnoDB email_data_inno_stage.