Non pensarci troppo. Basta aggiungerli insieme con un segno più.
SELECT products.ID, products.Base, COUNT(orders.ID) AS Counter,
products.Base + COUNT(orders.ID) as `SUM`
FROM products
LEFT JOIN orders ON products.ID = orders.Product_ID
GROUP BY products.ID
ORDER BY `SUM`
Nota:"SUM" è il nome di una funzione SQL aggregata, quindi dovrai racchiuderla in backtick per usarla come alias di colonna. Prendi in considerazione l'utilizzo di un nome diverso.