A parte l'aumento del tempo di elaborazione nel server MySQL e l'aumento del traffico (anche locale), no. Se lo aumenti, però, fai un benchmark prima e dopo il cambiamento. In questo modo puoi essere un po' più scientifico riguardo alle tue modifiche.
Non ho ragione al 100%, ma dai un'occhiata a questo:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/group-by-functions.html#function_group-concat
Link aggiornato per MySQL 8.0:https:/ /dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/aggregate-functions.html#function_group-concat
