Hai provato a nominare la tua stringa di connessione DbContext ? Il suo nome dovrebbe corrispondere al nome della classe.
In questo modo:
<add name="DbContext" connectionString="Server=111.222.333.444; Database=foo; Uid=foouser; Pwd=bar;" providerName="MySql.Data.MySqlClient" />
Non ho ancora provato con MySql, ma ho avuto problemi in passato con SQL Server quando non nominavo correttamente la stringa di connessione.
Cordiali saluti!