Perché SQLAlchemy esegue l'aggiornamento non funziona

Sembra che tu stia utilizzando zodb Transaction Manager in Pyramid.

Devi contrassegnare la sessione come modificata

http://www.upfrontsystems.co.za/Members/izak/sysadman/how-to-commit-a-transaction-even-when-sqlalchemy-thinks-the-session-is-clean

Dovresti fare qualcosa come

from zope.sqlalchemy import mark_changed
mark_changed(Session)

se non funziona prova

from zope.sqlalchemy import ZopeTransactionExtension
Session.configure(extension=ZopeTransactionExtension('changed'))