C'è un modo, vedi questo link:http ://blog.nth-design.com/2009/02/25/creating-sp-in-phpmyadmin/
Citazione da quel link
1.Apri phpMyadmin.
2.Seleziona un database con cui lavorare.
3.Apri la scheda SQL.
4.Seleziona tutte le istruzioni SQL tra le istruzioni DELIMITER in lo script della procedura memorizzata. Non includere le istruzioni DELIMITER! Ecco come dovrebbe essere il mio script di esempio:
DROP PROCEDURE IF EXISTS spFoo $$
CREATE PROCEDURE spFoo ()
BEGIN
SELECT 'Foo' FROM DUAL;
END $$
5.Nel campo delimitatore, appena sotto l'area di testo dell'editor SQL , inserisci $$ come delimitatore.