Hai mai pensato di utilizzare la clausola "IN" su MySQL?https://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/comparison-operators.html#function_in
Probabilmente avresti qualcosa come:
$query = "SELECT * FROM ".$wpdb->usermeta." WHERE meta_key='company' AND meta_value IN ('".implode("', ', $brand)."')";
(modifica: dimenticato di aggiungere la parentesi attorno al contenuto "in")
