È possibile che tu abbia alcune istruzioni di inserimento di grandi dimensioni che sono più grandi della tua dimensione massima. Controlla il tuo file /etc/mysql/my.cnf o ovunque si trovi. Non riesco a ricordare quale sia l'impostazione predefinita, ma può essere utile impostarla su qualcosa di grande come di seguito.
Questa è un'opzione
[mysqld]
max_allowed_packet = 16M
E forse l'altro modo
[mysqldump]
max_allowed_packet = 16M
