Puoi provare (parte InnoDB):https://dba.stackexchange.com/questions/57120/recover-mysql-database-from-data-folder-without-ibdata1-from-ibd-files/57157#57157
Raccomandamento :Potrebbe essere tardi nel tuo caso, tuttavia, prima di passare a un altro server, è una buona idea esportare i database in un file sql e importarlo da phpmyadmin, Mysql Workbech, SQLyog o terminale
Esporta:
mysqldump -u user -p password database_name > database_name.sql
Importa
mysql -u user -p password database_name < database_name.sql