L'hai detto tu
Devi cambiarlo nel percorso effettivo per eseguire la pera sulla tua installazione. Uso XAMPP sotto Windows e non ho problemi con questo perché ho cambiato il mio in .;\xampp\php\PEAR perché è qui che xampp default mette l'installazione di PEAR.
Ho dovuto anche cambiare alcune cose. Vedi la mia risposta in Come far funzionare PEAR su XAMPP (stack Apache/MySQL su Windows) domanda per i dettagli sulle modifiche alla configurazione della pera che ho dovuto apportare.