È simile alla query di Gordon Linoff, ma senza la sottoquery:
DELETE t1 FROM table t1
JOIN table t2
ON t2.refID = t1.refID
AND t2.ID < t1.ID
Questo utilizza un inner join per eliminare solo le righe in cui è presente un'altra riga con lo stesso ID di riferimento ma ID inferiore.
Il vantaggio di evitare una sottoquery è la possibilità di utilizzare un indice per la ricerca. Questa query dovrebbe funzionare bene con un indice a più colonne su refID + ID.