L'aggiunta di questa risposta a beneficio dei futuri ricercatori, poiché spiega perché l'aumento della dimensione del pacchetto ha risolto il problema:
Tratto da e grazie per post del blog di peter_laursen
Su OSX 10.7 (Lion), ho creato un file, /etc/my.cnf con i seguenti contenuti:
[mysqld]
max_allowed_packet = 12000000
E poi fermato il server MySQL:
/usr/local/bin/mysql.server stop
Quando si è riavviato automaticamente sono stato in grado di eseguire i miei inserti.