No.
Si indicizzano i campi che vengono cercati e hanno un'elevata selettività/cardinalità. La cardinalità di un campo booleano viene cancellata in quasi tutte le tabelle. Semmai, renderà le tue scritture più lente (di una quantità davvero piccola).
Forse lo renderesti il primo campo nell'indice cluster se ogni query prendesse in considerazione le eliminazioni software?