Per prima cosa esegui questa query
SHOW VARIABLES LIKE '%char%';
Hai character_set_server='latin1'
In tal caso, vai nel tuo file di configurazione, my.cnf e aggiungi o decommenta queste righe:
character-set-server = utf8
collation-server = utf8_unicode_ci
Riavvia il server. Sì, in ritardo alla festa, ho appena riscontrato lo stesso problema.