In MySql, puoi usare SUM() funzione su una condizione, poiché una condizione falsa sarà uguale a 0 , e uno vero sarà uguale a 1 :
SELECT SUM(userID_follower = $myID) AS followerCount,
SUM(userID_following = $myID) AS followingCount
FROM t1
WHERE userID_follower = $myID
OR userID_following = $myID