Hai già trovato una soluzione a questo?
Il codice seguente funziona per contrassegnare un ordine come completo, ma non esegue altre azioni come descrivi nell'amministratore
// create a new checkout instance and order id
$checkout = new WC_Checkout();
$this_order_id = $checkout->create_order();
$order = new WC_Order($this_order_id);
$order->update_status('completed');