SELECT id,
IF(type = 'P', amount, amount * -1) as amount
FROM report
Vedi http://dev.mysql.com/ doc/refman/5.0/en/control-flow-functions.html .
Inoltre, puoi gestire quando la condizione è nulla. In caso di importo nullo:
SELECT id,
IF(type = 'P', IFNULL(amount,0), IFNULL(amount,0) * -1) as amount
FROM report
La parte IFNULL(amount,0)
significa quando l'importo non è nullo restituisce l'importo altrimenti restituisce 0 .