Il percorso di installazione non è importante per la connessione al database da Java, le uniche cose importanti sono il nome host/indirizzo ip del server, la porta del server, il nome utente, la password e l'alias del database. Devi controllare che tutte queste informazioni non siano cambiate con il nuovo installazione. Prova a connetterti al tuo database Oracle con un client database, se la connessione funziona correttamente prova a connetterti dalla tua applicazione Java. Qui puoi leggere un semplice esempio:
http://www.mkyong. com/jdbc/connect-to-oracle-db-via-jdbc-driver-java/
Spero possa esserti utile.