Anche se non hai la chiave primaria, ogni record ha un rowid univoco associato.
Utilizzando la query seguente si eliminano solo i record che non hanno l'ID riga massimo unendo automaticamente una tabella con le colonne che causano la duplicazione. In questo modo eliminerai tutti i duplicati.
DELETE FROM PPLP_LOAD_GENSTAT plg_outer
WHERE ROWID NOT IN(
select MAX(ROWID)
from PPLP_LOAD_GENSTAT plg_inner
WHERE plg_outer.pplp_name = plg_inner.pplg_name
AND plg_outer.start_time= plg_inner.start_time
AND plg_outer.end_time = plg_inner.end_time
);