Se hai già installato MySQL e non hai eseguito uno spegnimento lento utilizzando il
innodb_fast_shutdown
Flag, vai semplicemente alla tua directory MySQL
/var/lib/mysql/
E rimuovi i file di registro (Non farlo se hai bisogno dei dati della tabella nel tuo database fino a hai eseguito il backup del tuo database):
ib_logfile0
ib_logfile1
Esegui il backup prima se ne hai bisogno di nuovo.