La versione che Ubuntu ha nei propri repository è piuttosto vecchia. Puoi aggiungere CRAN al tuo sources.list e ottieni l'ultima versione tramite quel repository. Leggi le istruzioni in questa pagina per ulteriori informazioni.
Per quanto riguarda la tua vera domanda, sembra che una chiamata a socketConnection include un argomento di input che non supporta. Controlla quale versione del pacchetto stai utilizzando, è la stessa di Windows 7? Inoltre, aggiorna la tua versione di R alla 2.15 utilizzando il link sopra.
