Devi creare i tuoi updates
oggetto in due passaggi:
var updates = { $push: {} };
updates.$push["array.$.array2." + index + ".answeredBy"] = userId;
Aggiorna
Ora che node.js 4+ supporta calcolato nomi di proprietà , puoi farlo in un solo passaggio:
var updates = { $push: {
["array.$.array2." + index + ".answeredBy"]: userId
} };