MongoDB
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Modo/posto consigliato per creare l'indice sulla raccolta MongoDB per un'applicazione web

Lo metterei quando inizializzi l'applicazione. Se la raccolta non esiste quando chiami sureIndex, l'indice (e la raccolta) verranno creati in quel momento.

Presumo che tu sappia a priori che tipo di query eseguirai sui dati e che tipo di dati inserirai nell'indice, ovviamente.