Uno degli sviluppatori del driver, mi ha parlato di un costruttore molto interessante. Spero che questo possa essere utile a qualcuno in futuro:
// Get all documents created today.
var query = Query.And(
Query.GTE("_id", new ObjectId (DateTime.UtcNow.Date,0,0,0)),
Query.LT ("_id", new ObjectId (DateTime.UtcNow.Date.AddDays(1),0,0,0)));